衢州复旦研究院首批入驻项目共16个，涉及创新小分子化学药、生物大分子药物、核药及创新制剂等。
| 序号 | 类型 | 负责人 | 项目名称 |
| 1 | 创新小分子药物 | 周璐 | 抗干眼病的小分子治疗药物 |
| 2 | 赵伟利 | BODIPY类光敏剂光动力治疗痤疮研究 | |
| 3 | 丁滪 | ATTEC技术靶向自噬降解帕金森病致病蛋白 | |
| 4 | 沈晓燕 | SNX10抑制剂抗炎症性肠病研发 | |
| 5 | 董肖椿 | 抗肿瘤恶病质小分子新药研发 | |
| 6 | 穆青 | 槐黄酮化合物协同索拉非尼抗肝癌 | |
| 7 | 创新生物大分子药物 | 鞠佃文 | PD-L1单抗与sST2双功能蛋白 |
| 8 | 徐建青 | 重组非洲猪瘟疫苗 | |
| 9 | 创新核药 | 季斌 | 放射性诊疗药物的开发 |
| 10 | 陆伟 | 131|-放疗栓塞微球 | |
| 11 | 创新制剂 | 王建新 | 微丸型缓控释制剂研究 |
| 12 | 魏刚 | 治疗老年黄斑变性的纳米晶滴眼液研发 | |
| 13 | 孙涛 | 多肽药物偶联体靶向递药平台 | |
| 14 | 沙先谊 | 基于口鼻吸入给药技术平台的创新制剂开发 | |
| 15 | 戚建平 | 多肽药物鼻腔吸入制剂 | |
| 16 | 成药性评价平台 | 相小强 | 定量药理引导的成药性平台QuantOrgan的搭建 |
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